Ympäristöterveydenhuollon valvonnan toimeenpano kunnassa käsittää tällä hetkellä elintarvike-, eläinlääkintähuolto-, tupakka- sekä terveydensuojelu- että kuluttaja- ja tuoteturvallisuuslain mukaisen valvonnan toimeenpanon. Kuntien valvonnan ohjaus on sekä aluehallintovirastojen että ympäristöterveydenhuollon keskusvirastojen (Evira, Valvira sekä Tukes) tehtävä. Sipilän strategisen hallitusohjelman liitteessä kolme todetaan kuntien ohjauksen ja valvonnan osalta, että hallitus käy läpi kaikki kuntien ja valtion kuntiin kohdistamat ohjaavat ja valvovat prosessit. Valtion talouden tarkastusviraston ympäristöterveydenhuoltoa koskevassa tarkastuskertomuksessa (7/2014) ympäristöterveydenhuollon valvonnan ohjauksen monikanavaisuus todettiin ohjauksen yhtenäisyyden kannalta merkittävimmäksi haasteeksi. Edellä esitettyjen ympäristöterveydenhuoltoa koskevien ongelmien ratkaisemiseksi sosiaali- ja terveysministeriö yhteistyössä maa- ja metsätalousministeriön kanssa käynnisti selvityksen erityisesti ympäristöterveydenhuollon ohjauksen uudistamiseksi. Selvitysmiehen tehtävänä oli tehdä aiempien selvitysten pohjalta ehdotuksia vaihtoehdoista kunnallisen ympäristöterveydenhuollon ohjauksen uudistamiseksi valtion hallinnossa. Selvitysmies haastatteli useita ympäristöterveydenhuollon eri toimialojen ja toiminnan tasoja edustavien henkilöitä sekä eri sidosryhmiä edustavia henkilöitä. Keskeisimmät ehdotukset kohdistuvat ympäristöterveydenhuollon ohjauksen moniportaisuuden vähentämiseen, yhteistoiminnan parantamiseen ministeriöiden ja keskusvirastojen kesken sekä valvontaohjelmien sekä riskinarvioinnin kehittämiseen. Ehdotuksiin sisältyy aluehallintovirastojen ohjausresurssin siirtäminen keskusvirastotasolle moniportaisuuden vähentämiseksi. Ehdotukset kohdentuvat myös valvontaa suorittavien henkilöiden työnohjauksen ja koulutuksen varmistamiseen kuin myös kentän ja sitä ohjaavien tahojen vuoropuhelun vakiinnuttamiseen sekä yleisemminkin ympäristöterveydenhuollon tietohuollon ja informaation kehittämiseen.